Die Gründung der EMA motivierte sich aus den schwierigen Bedingungen für das Bestehen familiärer landwirtschaftlicher Betriebe, die sich auch durch die brasilianische Agrarreform nicht auflösen ließen. So wird der Umweltzerstörung mit der Vernichtung der wichtigsten natürlichen Ressourcen Wasser Boden und Vegetation als entscheidender Faktor für die Verarmung der ländlichen Familien identifiziert. In Maranhão arbeitet die Institution in ländlichen Gemeinden und Ansiedlungsprojekten des Nationalen Instituts für Kolonisierung und Agrarreform (INCRA). Hier werden die Städte Cantanhede, Codó, Timbiras, Pirapemas, Brejo, Monção, Cajarí, Central do Maranhão, Mirinzal, Amarante do Maranhão, Açailândia, Itinga do Maranhão, São Raimundo das Mangabeiras, Santa Luzia do Paruá, Presidente Médici e Maranhãozinho, begünstigt, die sich in den Wassereinzugsgebieten der Flüsse Itapecuru, Parnaíba, Mearim, Pindaré, Tocantins, Gurupi, Turiaçu und Pericumã befinden, die sich von der Nordküste der westlichen Flachlandsavanne bis in den Süden des Bundesstaates, von der Grenze mit Piauí bis zur Grenze mit Pará erstrecken. Insgesamt erhalten in dieser Region über 2.500 Familien Unterstützung.

EMA entwickelt Maßnahmen und Strategien zur Wiederherstellung und landwirtschaftlichen Nutzung degradierter Flächen, insbesondere in Auwäldern und Quellbereichen. Im Rahmen von Wiederaufforstungsprojekten wurden bereits über 1.500.000 Setzlinge unterschiedlicher einheimischer Arten produziert und verpflanzt.

Bei der Produktion der Setzlinge kamen Bewässerungssysteme zum Einsatz, die über solarbetriebene Pumpen gespeist werden. Als Anbauweisen werden Methoden und Techniken genutzt, die eine Kombination von landwirtschaftlicher Produktion und Viehzucht in Polykultursystemen ermöglichen und auf traditionellem Wissen basieren. So wird beispielsweise die einheimische Leguminosenart Sabiá (Mimosa caesalpiniefolia Benth) für Mischkulturflächen genutzt. Die reihenförmige Anordnung der Sabiá ermöglicht die Nutzung von einjährigen Kulturpflanzen in den Zwischenräumen der Reihen, wobei Sabiá ein großes Potential in der Wiederherstellung der Bodenfruchtbarkeit aufweist und als Sonnen- und Windschutz fungiert, was sich positiv auf Ernteerträge auswirkt. Weiterhin bietet Sabiá die Möglichkeit der einheimischen Holzproduktion, z.B. für den Verkauf als Zaunpfähle. Ein weiteres Polykultursystem stellt die kombinierte Produktion von Reis und Fisch in gefluteten Reisfeldern an bei gleichzeitiger Nutzung der Deiche für den Anbau von Gemüse und Obst. Diese Aktivitäten wurden über zwei Abkommen mit dem Sektor Umweltschutz INCRA Maranhão (von 2009-2012 und ab 2013) entwickelt, beide betreffen die Wiederherstellung degradierter Flächen, über ein Regierungsabkommen zur technischen Beratung in der landwirtschaftlichen Erschließung (ATER). Über die Kooperation mit der Fachrichtung Agrarökologie der staatlichen Universität von Maranhão (UEMA) werden zudem akademische Arbeiten, wie beispielsweise Forschungsarbeiten im Rahmen einer laufenden Dissertation, ermöglicht.